從土壤中輕松獲取高質(zhì)量RNA
編輯：百泰克 上傳時(shí)間：2018-02-24 瀏覽次數(shù)：12844
眾所周知，從土壤中提取DNA已非易事，而想從中再提取RNA可說是難上加難。DNA不容易提取是因?yàn)楸旧硗寥乐懈患牟牧暇蜕伲崛∵^程相對(duì)復(fù)雜，造成操作損失；而RNA不容易提取除了以上所提到的原因外，還有一個(gè)很關(guān)鍵的原因——無處不在的RNA酶，對(duì)RNA的穩(wěn)定存在構(gòu)成極大威脅。另外還有一點(diǎn)就是土壤中某些物質(zhì)的微量殘留都會(huì)影響到科研人員后期PCR反應(yīng)。這就是目前國際國內(nèi)市場中土壤RNA提取產(chǎn)品不多的原因。
因此要想對(duì)土壤RNA有較好的提取效果，我們就必須知己知彼，既要對(duì)研究對(duì)象（土壤）熟知，又要對(duì)研究工具（試劑盒）熟悉。
土壤中重要物質(zhì)腐殖質(zhì)
土壤除了為陸生植物提供營養(yǎng)源和水分之外，還是植物生長，進(jìn)行光合作用、能量交換的主要場所；同時(shí)也具有微生物生長繁殖所需要的一切營養(yǎng)物質(zhì)及各種條件，是微生物良好的生活場所，有“微生物的天然培養(yǎng)基”之稱。因此土壤是一種重要的環(huán)境要素。
簡單說，土壤是由固相（礦物質(zhì)、有機(jī)質(zhì)）、液相（土壤水分或溶液）和氣相（土壤空氣）三相物質(zhì)四種成分有機(jī)地組成。而所有這些組成在土壤微生物的存在下卻能形成一種對(duì)作物生長有利，對(duì)科研人員非常不利的物質(zhì)——腐殖質(zhì)。污泥中也不例外，同樣有腐植酸和富里酸存在。
腐殖質(zhì)是由一些異養(yǎng)的微生物，如某些腐生細(xì)菌，把土壤中的動(dòng)、植物殘?bào)w和有機(jī)肥料分解，與礦物質(zhì)顆粒緊密結(jié)合在一起而形成的一種黑色的膠狀物質(zhì)，是土壤有機(jī)質(zhì)的主要類型，一般占土壤有機(jī)質(zhì)總量的85—90％以上。腐殖質(zhì)既含有氮、磷、 鉀、疏、鈣等大量元素，還有微量元素；另外在分解過程中還會(huì)產(chǎn)生腐殖酸、有機(jī)酸、維生素及一些激素等。在水體中，腐殖質(zhì)主要指腐殖酸和富里酸。實(shí)驗(yàn)證明，微量腐殖酸或富里酸的存在就會(huì)導(dǎo)致PCR的失敗！這在眾多公司的提取試劑盒中都有相應(yīng)說明。
再加上近期土壤污染（肥料、農(nóng)藥等）的存在，因此導(dǎo)致提取對(duì)象成份非常復(fù)雜，提取難度也就可想而知。有的公司產(chǎn)品即使有少量的RNA提出，也會(huì)造成科研人員后期的實(shí)驗(yàn)不順暢，這樣的例子已司空見慣。下面是一組污染土壤和造成污染原因的圖片。
