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雙鏈 DNA 超敏檢測(cè)試劑盒

產(chǎn)品特點(diǎn):

【產(chǎn)品名稱】 DNA 測(cè) 稱:Qubit® dsDNA HS Assay Kits

【包裝規(guī)格】 100 &500 /

【用途】

常規(guī)的DNA含量的檢測(cè)方法是在260nmA260)處測(cè)其吸光值。這種方法的主要缺點(diǎn)是核苷酸、單鏈核酸和蛋白質(zhì)對(duì)信號(hào)的影響很大,并且還會(huì)受到核酸制備過程中污染物的干擾,無法區(qū)分DNARNA,而且這種方法不靈敏(5μg/mLdsDNA溶液A260=0.1)。PicoGreen定量檢測(cè)方法簡(jiǎn)單、方便,被多家生物制品廠所選擇,成為生物制品殘留DNA檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)。目前該方法已納入2010年版《中國(guó)藥典》

例如:Nanodrop系列微量分光光度計(jì)目前最常見的紫外吸光法檢測(cè)測(cè)樣品的濃度及純度, 由于它會(huì)檢測(cè)吸光度在260nm處所有物質(zhì)的吸光值(如DNA/RNA以及降解核酸和游離核苷酸等其他雜質(zhì)),因此讀數(shù)并不是十分準(zhǔn)確。而熒光計(jì)通過熒光染料與特定目標(biāo)分子結(jié)合后,檢測(cè)其熒光強(qiáng)度來測(cè)目標(biāo)分子的濃度,因此其定量結(jié)果一般低于A260nm處的讀數(shù),但是更為準(zhǔn)確。

重要的是準(zhǔn)確的DNA定量對(duì)于后續(xù)應(yīng)用至關(guān)重要。 Nanodrop系列全波長(zhǎng)微量分光光度計(jì)無法精確測(cè)定 5ng/ul 以下的 DNA 濃度,然而,許多 DNA 樣品又恰在這個(gè)范圍之內(nèi)在檢測(cè)雙鏈 DNA 時(shí)熒光計(jì)的檢測(cè)極限可達(dá) 0.5pg/ul。此時(shí),更靈敏的熒光計(jì)似乎是個(gè)更好的選擇。 熒光計(jì)和相應(yīng)的定量試劑盒,能快速靈敏、精確測(cè)定 DNA 的濃度。

本試劑將被用于成本昂貴的下游實(shí)驗(yàn):qPCR PCR 克隆、轉(zhuǎn)染和新一代測(cè)序等精密測(cè)定的實(shí)驗(yàn),精準(zhǔn)定量范圍10pg /μL10ng/μL

【檢驗(yàn)原理】

PicoGreenDNA雙鏈結(jié)合后才發(fā)出的熒光,無DNA不發(fā)熒光;所發(fā)熒光與DNA濃度成正比。在2010年《中國(guó)藥典》中提出,PicoGreen定量DNA的方法檢出限約10pg/uLDNA含量在10pg/uL~10ng/uL 范圍時(shí)線性較好(R2>0.99). 本試劑盒利用 Picogreen DNA 染料能夠特異性結(jié)合雙鏈 DNA,而不與蛋白質(zhì)、RNA、鹽離子結(jié) 合的原理,通過激發(fā)光照射,Qubit 檢測(cè)儀收集發(fā)射光,特異的分析樣品中雙鏈 DNA 的實(shí)際含量,能夠 排除樣品中蛋白質(zhì)、RNA、鹽離子等物質(zhì)的干擾,從而對(duì)雙鏈DNA進(jìn)行精準(zhǔn)的定量。

優(yōu)點(diǎn):

該方法可以測(cè)定來源于任何表達(dá)宿主樣品中的雙鏈DNA

可以直接定量PCR擴(kuò)增產(chǎn)物而無需從反應(yīng)混合物中純化DNA

遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出傳統(tǒng)紫外A260的檢測(cè)方法和Hoechst33258的靈敏度。

特異性檢測(cè)與Mg2+、氯化鈉、醋酸鈉、醋酸銨、乙醇、苯酚、氯仿、SDSRNA、蛋白質(zhì)、Triton-X100dNTPSBSA等干擾物沒有交叉反應(yīng)

在等摩爾濃度 ssDNA RNA 存在的條件下測(cè)定 dsDNA,其影響很小。

所需器材Qubit® assay tubes (500 tubes, Life Technologies, Cat. no. Q32856)或者 Axygen® PCR-05-C tubes(VWR, part no. 10011-830) 熒光儀(Qubit 2.0 Qubit 3.0 等熒光儀)

【注意事項(xiàng)】

1. 檢測(cè)溫度:所有檢測(cè)必須在室溫操作(22–28?C)

2. 孵育時(shí)間:DNA 與工作液混合后,反應(yīng) 3min,熒光信號(hào)在 3 個(gè)小時(shí)內(nèi)都是穩(wěn)定的。

3. 熒光校準(zhǔn):每次使用前,請(qǐng)按照批次使用校準(zhǔn),以確保實(shí)時(shí)檢測(cè)數(shù)據(jù)的一致性。

試劑盒組份

Components

100assays

500 assays

Concentration

Storage

Qubit dsDNA HS Reagent (Component A)

50μL

0.25mL

200X in DMSO

4oC

Protect from light

12months

dsDNA HS Buffer (Component B)

10mL

50mL

TE Buffer

dsDNA HS Standard#1 (Using Component B)

N/A

N/A

0 ng/uL in TE Buffer

dsDNA HS Standard#2(Component C)

0.2mL

1mL

10 ng/uL in TE Buffer

*備注:不同批次的試劑不可混合使用:

【檢驗(yàn)方法】

1. 實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備:

1)在使用前,將試劑盒中的各組分恢復(fù)至室溫。

2)準(zhǔn)備足夠量 0.5 mL PCR 薄壁管并標(biāo)注。請(qǐng)勿在 PCR 管側(cè)壁標(biāo)注,以免影響熒光信號(hào)采集。推薦使用 Qubit®  assay tubesCat. No. Q32856)或 Axygen® PCR-05-C tubesCat. No. 10011-830)。

2. 配制檢測(cè)工作液

在塑料容器中,使用 dsDNA Buffer 按比例將適量dsDNA Reagent 稀釋至(例:取1 μL dsDNA Reagent加入 199 μL dsDNA Buffer),現(xiàn)用現(xiàn)配。工作液配制好后,3小時(shí)內(nèi)使用。

3. 配制待檢樣品

1)配制待檢標(biāo)準(zhǔn)品。取 190 μL 檢測(cè)工作液至標(biāo)準(zhǔn)品 PCR 管中,分別加入 10 μL dsDNA Standard 1 dsDNA Standard 2 至相 應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)品 PCR 管中,輕輕渦旋振蕩 2-3 sec,盡量避免氣泡產(chǎn)生。

2)配制待檢樣品。取 180-199 μL 檢測(cè)工作液至樣本 PCR 管中,分別加入 1-20 μL 待檢樣本,使 PCR 管中每個(gè)樣本終體積 為 200 μL,輕輕渦旋振蕩 2-3 sec,盡量避免氣泡產(chǎn)生。

4. 檢測(cè)

1)將所有待檢 PCR 管置于室溫避光孵育 2 min

2)按照 Qubit®熒光儀的操作說明,選擇 dsDNA High Sensitivity 檢測(cè)程序測(cè)定熒光信號(hào)值。

【操作流程圖例】


2. Qubit® 3.0 操作步驟

2.1 Qubit® 3.0 主屏幕操作頁面,選擇 DNA,然后選擇檢測(cè)類型 dsDNA High Sensitivity。顯示“Read standards”,選擇 Read Standards 進(jìn)行檢測(cè)。

2.2 將裝有 Standard #1 管子插入樣品槽中,關(guān)閉上蓋, 按鍵 Read standard. 讀取完成后(~3 seconds), 移走 Standard #1

2.3 將 裝有 Standard #2 管子插入樣品槽中,關(guān)閉上蓋, 按鍵 Read standard. 讀取完成后(~3 seconds), 移走 Standard #2

2.4 按鍵 Run samples

2.5 在讀取頁面,選擇相應(yīng)的單位和體積;

2.5.1 從旋轉(zhuǎn)輪面板上選擇+-按鈕來選擇添加到試管中的樣品體積(從1 - 20μl);

2.5.2 從下拉菜單中選擇測(cè)量樣品濃度的濃度單位。

2.6 將裝有待測(cè)樣品的管子插入樣品槽中,關(guān)閉上蓋, 按鍵 Read ,讀取完成后(~3 seconds), 移走樣品, 直至樣品測(cè)完。

3. Qubit® 2.0 操作步驟

3.1 Qubit® 2.0 主屏幕操作頁面,選擇 DNA,然后選擇檢測(cè)類型 dsDNA High Sensitivity。顯示“Read standards”

選擇 Read Standards 進(jìn)行檢測(cè)。

3.2 將裝有 Standard #1 的管子插入樣品槽中,關(guān)閉上蓋,按鍵 Read standard. 讀取完成后(~3 seconds), 移走 Standard #1

3.3 將 裝有 Standard #2 管子插入樣品槽中,關(guān)閉上蓋, 按鍵 Read standard. 讀取完成后(~3 seconds), 移走 Standard #2

3.4 按鍵 Run samples

3.5 將裝有待測(cè)樣品的管子插入樣品槽中,關(guān)閉上蓋, 按鍵 Read,讀取完成后(~3 seconds),移走樣品,直至樣品測(cè)完。

3.6 按照200/X公式計(jì)算管中DNA濃度。

樣品濃度 = QF value ×QF Value :Qubit® 2.0 直接測(cè)量得到樣品的結(jié)果;X:加入的樣品的體積)

污染物對(duì) dsDNA 定量檢測(cè)試盒檢測(cè)結(jié)果的影響

Effect of contaminants in the Qubit ® dsDNA HS Assay, tested over a range of 1–500 ng/mL

污染物

Contaminant

10 μL 中的

Concentration in10 μL Sample

品檢測(cè)時(shí)濃度

Final Concentration in the assay

測(cè)結(jié)果

Result

Salts

Ammonium acetate

200 mM

10 mM

OK

Sodium acetate

200 mM

10 mM

OK

Sodium chloride

200 mM

10 mM

OK

Magnesium chloride

40 mM

2 mM

OK

Organic Solvents

Phenol

2%

0.1%

OK

Ethanol

20%

1%

OK

Chloroform

4%

0.2%

OK

Detergents

Sodium dodecyl sulfate

0.2%

0.01%

OK

Triton X-100

0.02%

0.001%

OK

Other Compounds

Bovine serum albumin

400 μg/mL

20 μg/mL

OK

RNA

*

*

OK

dNTPs

2 mM

100 μM

OK

Polyethylene glycol

20%

1%

OK

Agarose

2%

0.1%

OK

*1×:表示含有與 dsDNA 相同濃度的 RNA

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